VIRTUAL’HIS
Biologie intégrative imagerie santé environnement
Structure(s) de rattachement :
Organisation
Responsables
Responsables scientifiques
Site CHU de Caen
Avenue de la Côte de Nacre – CS 3001 – 14033 Caen Cedex 9
Guenaelle Levallet
02 31 06 31 34 | guenaelle.levallet@unicaen.fr
Site CLCC F. Baclesse
3 avenue du Général Harris – 14076 Caen Cedex 5
Nicolas Elie
02 31 56 58 81 | nicolas.elie@unicaen.fr
Responsables techniques
Maëlle Guyot
02 31 56 82 12 | maelle.coquemont@unicaen.fr
Florence Giffard
02 31 45 52 20 | giffard-f@baclesse.unicancer.fr
Présentation
VIRTUAL’HIS est une plateforme universitaire de l’unité de service PLATON qui accompagne les utilisateurs de la prise en charge des prélèvements biologiques (tissus/cellules) à leurs interprétations. La plateforme a une expertise méthodologique et analytique concernant l’utilisation des différentes techniques d’Histologie. VIRTUAL’HIS propose également, de manière unique en Normandie, l’acquisition et l’analyse des images « grand champ » (lames virtuelles) en lumière blanche et en fluorescence.
VIRTUAL’HIS propose, en plus d’un panel d’algorithmes reconnus dans la littérature, des procédures originales (brevetées) et des procédures de contrôle de qualité des résultats de l’analyse des images (y compris quantitative), s’appuyant sur la stéréologie.
VIRTUAL’HIS regroupe les savoir-faire de personnels de l’université de Caen Normandie et du CLCC François Baclesse.
Activités
La plateforme est ouverte aux laboratoires publics ou privés, régionaux, nationaux et internationaux et nous accomplissons, en plus de notre mission de prestation, des missions de conseil et de formation.
La plateforme propose les services suivants :
- Prise en charge du prélèvement :
- Macro- ou micro-dissection
- Préparation
- Inclusion
- Réalisation de coupes au cryostat ou au microtome
- Exploitation du prélèvement :
- Colorations histologiques standards ou spécifiques
- Immunohistochimies simples ou multiplexées en chromogène ou fluorescence
- Histoenzymologie
- Hybridation In Situ
- Microdissection laser
- Analyse :
- Numérisation de lames de lames virtuelles
- Lumière blanche et fluorescente
- Analyses numériques/quantitatives
- Lectures histologiques avec rédaction de rapport
Équipements
Équipements spécifiques à la plateforme
- Cytospin
- Station d’enrobage en paraffine Sakura Tissue TEK TEC 5
- Cryostat DAKEWE 6250
- Microtome Leica RM2245
- Automate de coloration et colleuse de lames
- Système d’imagerie macroscopique
- 2 automates d’immunohistochimie Ventana Discovery ULTRA
- Automate d’immunohistochimie Ventana Discovery XT
- Microdissecteur LASER Excilone Arcturus XT
- Scanner Olympus VS120, 100 lames, 40x, 10x, 20x, 40x et 60x, lumière blanche, fluorescence (DAPI, FITC, Cy3, Cy5, Cy7)
- Postes de travail pour l’analyse des images
- Suite de logiciels Halo pour l’analyse des lames virtuelles (IndicaLabs)
Équipements accessibles à la plateforme
- Scanner Vectra Polaris (acquisition de préparations multiplexées jusqu’à 9 marqueurs fluorescents) (Plateforme ORGAPRED)
- Tissue Microarrayer (plateforme ORGAPRED)
Le stockage des données est assuré par les serveurs sécurisés de l’Université de Caen Normandie.
Partenariats et financements
VIRTUAL’HIS est régulièrement soutenue par le Conseil Régional de Normandie et par l’Europe. Des équipements de la plateforme ont ainsi pu être acquis en particulier dans le cadre des projets ONCOTHERA et VIRTUAL’HIS, cofinancés par l’Union européenne et la Région Normandie dans le cadre du programme opérationnel FEDER/ FSE 2014-2020. Le projet EquipInnovCaen2022 – Platonus-one est financé par des fonds FEDER dans le cadre du programme opérationnel FEDER/FSE bas-normand 2014-2020.
Informations complémentaires
Modalités d’accès à la plateforme
Les prestations proposées par la plateforme VIRTUAL’HIS peuvent être réalisées soit sous forme de partenariats de recherche soit sous forme de prestations de services ou encore de prestations élargies à la mise au point et à la validation de nouvelles méthodes. Dans le cadre d’un partenariat de recherche, une offre de formation de personnels peut être proposée.
Pour toute demande de prestations, il est nécessaire de contacter les responsables scientifiques de la plateforme afin de permettre l’évaluation de la faisabilité du projet et des conditions expérimentales.