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Centre de Microscopie Appliquée à la Biologie · CMABio3

Biologie intégrative imagerie santé environnement

Université Caen Normandie
UFR des sciences,
campus 1 · bâtiment M · sous sol
Esplanade de la paix
14032 Caen cedex 5

02 31 56 58 13

cmabio3@unicaen.fr

Organisation

Responsables

Jean-Christophe Avice

Les activités sont organisées sur trois plateaux techniques : CMAbio, AIM, MicroFluDesign

  • Le plateau de microscopie (CMAbio) est équipé pour l’observation d’échantillons aux différentes échelles tissulaires, cellulaires et ultrastructurales par microscopie photonique et électronique. Ce plateau technique peut prendre en charge toutes les étapes du traitement d’échantillons biologiques et leur observation en microscopie électronique à transmission (MET). L’ingénieur a aussi un accès aux MEB, MEB-EDS, LVMEB du CRISMAT (ENSICAEN). Le service dispose d’un vibratome, d’une cytocentrifugeuse d’un appareil à point critique, d’un ultramicrotome, d’un cryoultramicrotome, d’un système de cryobusbtitution et d’un système de cryotransfert pour MEB. Nous disposons aussi d’équipements pour des diverses modalités d’observation en macroscopie, microscopie lumière blanche/fluoresence et microscopie confocale à balayage laser. Le personnel affecté au plateau accompagne les chercheurs dans leurs travaux en leur transmettant leur savoir-faire et accueille des étudiants au cours de formations courtes pour leur faire découvrir ces technologies.Contacts :  Nicolas ÉLIE (photonique)  et Didier GOUX (électronique)

     

  • Le plateau d’analyse d’images multimodales (AIM) accompagne les travaux de recherche des équipes institutionnelles et industrielles, pour la mise au point de procédures de traitement et d’analyses d’images d’échantillons biologiques. Il a également une mission de formation et de conseil sur les techniques d’acquisition, de traitement et d’analyse d’images pour les chercheurs mais aussi pour les étudiants de l’Université.Contacts :  Nicolas ÉLIE
  • Le plateau MicroFluDesign qui est un plateau dédié à la conception et la production de puces/systèmes microfluidiques dédiés à la biologie. Les équipements permettent e développement de compétences synergiques et originales en microfluidique, microscopie et analyses de micro-environnements. Ces approches pourront être couplées à la microscopie et l’analyse chimique et moléculaire de micro-environnements complexes pour la caractérisation du vivant et de la biodiversité. Des approches continue (micro canaux) ou discrète (de gouttes dite microfluidique digitale) peuvent permettre d’effectuer des opérations variées en parallèle sur un grand nombre d’échantillons basées notamment sur du tri cellulaire (à des fins de diagnostic ou biotechnologique). Ces dispositifs d’analyse microfluidique sont fabriqués le plus souvent avec les outils de la microélectronique, et peuvent par exemple être des « organes sur puces » ou des « plantes sur puces ». L’ensemble du personnel du service va acquérir ces techniques pour les mettre au service de la communauté. Venez avec vos questions et vos échantillons.Contacts :  Didier GOUX, Nicolas ÉLIE

Présentation

Le CMAbio3 conseille, accompagne et forme ses utilisateurs à l’utilisation de différents type de microscopes photoniques et électroniques, d’équipements de préparation d’échantillons et de microfluidique. Le CMAbio3 est spécialisée dans la préparation des échantillons pour la microscopie électronique en biologie. Le service dispose d’une chaîne de fabrication de puces microfluidique et  un système de gestion microfluidique est aussi disponible. Enfin, la plateforme propose un service de traitement et d’analyse des images d’échantillons biologiques obtenues à partir de nos systèmes ou d’autres capteurs. Ils sont réalisés à l’aide de logiciels libres et des applications plus spécifiques peuvent être développées en interne. Le personnel du CMAbio3 effectue des prestations, du conseil, forme les étudiants, techniciens, chercheurs de l’Université ou les utilisateurs externes à l’établissement, à toutes les techniques de préparation, d’observation des échantillons et de traitement/analyse des images.

Équipements

  • Microscopes optiques de lumière blanche et de fluorescence
  • Microscope confocal (6 ray LASERS)
  • Microscope électronique à transmission, accès au MET EDS et ARM du CRISMAT
  • Accès à des Microscopes électroniques à balayages-EDS et système de cryotransfert
  • Macroscope motorisé
  • Système de microscopie corrélative optique/MEB
  • Vibratome
  • Cytocentrifugeuse
  • Système de cryosubstitution
  • Appareil à contournement du point critique
  • Ultramicrotome
  • Cryo-ultramicrotome
  • Système de glow discharge
  • Système de microinjection
  • Chaîne de fabrication de puces PDMS (Dilase 125)
  • Système de gestion microfluidique
  • Fraiseuse 5 axes

LOGICIELS, SERVEUR

ZEN, ZEN Connect, Olympus CellSens, Digital Micrograph, Qupath, ImageJ, FIJI, Ilastik, OMERO.