L'organisation matérielle du séminaire annuel du Pôle maritime comporte, selon les années, trois à quatre séances tenues à la MRSH de Caen, avec deux intervenants par séance ; une séance annuelle d'une journée tenue à l'Université du Havre, avec cinq intervenants, et une séance finale d'une journée délocalisée au Musée maritime de l'île Tatihou ou dans une collectivité territoriale (par exemple Port-en-Bessin en 2008), avec encore cinq intervenants. Ce sont entre 15 et 20 communications qui sont ainsi présentées annuellement.

Ces séminaires sont pluridisciplinaires, comme le veut la finalité du Pôle maritime, puisqu'au cours de la période considérée sont intervenus des historiens, des linguistes, des ethnologues et des juristes.  Ils ont vu s'exprimer des enseignants-chercheurs, des doctorants, mais aussi, ce qui fait peut-être leur particularité, des professionnels du monde de la mer : marin, plongeur, gestionnaire de port, représentant de l'action de l'État en Mer, conchyliculteur, sont par exemple venus croiser leurs approches avec celles des universitaires. Il en a résulté des débats particulièrement enrichissants. Le public de ces séminaires est constant : entre 20 et 30 personnes lors des séminaires tenus à Caen, entre 30 et 40 lors des journées d'étude délocalisées. Il est composé de chercheurs, universitaires ou non, et d'étudiants souvent inscrits dans un doctorat touchant au domaine maritime.

Il faut aussi souligner que ces séminaires s'inscrivent dans le cadre du Master 2 « Recherche » en histoire moderne et contemporaine.

Thématiques abordées depuis la création du Pôle :

  • Séminaire inaugural traitant des thématiques couvertes par l'intitulé du Pôle (2003-2004)
  • Le navire (2004-2005)
  • Le littoral, espace convoité, espace partagé (2005-2006)
  • Usages et usagers de la mer (2006-2007)
  • Ports et activités portuaires (2007-2008)
  • Périls, accidents et fortunes de mer (2008-2009)
  • Le voyage maritime (2009-2010)
  • Les ressources marines (2010-2011)
  • Le commerce maritime / le vocabulaire maritime et les dictionnaires (2011-2012)
  • Le littoral, contrôle, surveillance et usage des côtes (2012-2013)